Octobre 2008 N°24
Plateforme Génomique Fonctionnelle
: une expertise et du matériel performant au service des scientifiques
marocains
Au sein des UATRS (Unités
d'Appui Technique à la Recherche Scientifique), division du CNRST
(Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique), existe
une plateforme génomique fonctionnelle, qui a pour objectif de
mettre à la disposition de la communauté scientifique
marocaine (académique et industrielle) des équipements
de pointe et une expertise dans le domaine de la Génomique Fonctionnelle.
Que ce soit dans le domaine de la médecine, de l’agroalimentaire,
de l’énergie, de l’environnement, de la biotechnologie
ou du forensic, la Plateforme Génomique Fonctionnelle dispose
d’une équipe dédiée aux prestations d'analyse,
au conseil dans la mise en place de projets dans le domaine de la génomique
et à la veille technologique.
Afin de mener à bien les services proposés, la plate forme
dispose des laboratoires suivants :
- Laboratoire d’analyse des acides nucléiques :
extraction des acides nucléiques à partir de
sources diverses, clonage des gènes, digestion enzymatique, quantification
des acides nucléiques, analyse électrophorétique
…
- Laboratoire de synthèse d’oligonucléotides
: production d’oligonucléotides (amorces, sondes,
LNA, siRNA) standards et modifiés, options de purification :
OPC (cartouche de dessalage) et HPLC, modifications disponibles : fluorophores,
Alexa, Biotine…etc.
Ce labo est pourvu d’un synthétiseur à plaques de
96 puits, un synthétiseur de paillasse et d’une HPLC semi-préparative.
- Laboratoire de séquençage et génotypage
: séquençage de novo, reséquençage,
détection des hétérozygotes/mutations, génotypage
des SNP, quantification fluorescente relative, analyse des microsatellites,
analyse AFLP.
Pour ce faire, ce labo dispose d’un système d’analyse
génétique et de séquençage d’ADN par
électrophorèse capillaire.
Ces prestations peuvent être appliquées pour le diagnostic
médical, les industries pharmaceutiques, la biotechnologie animale
et végétale, l’agroalimentaire, le forensic…
- Laboratoire de PCR en temps réel : ce laboratoire
est muni d’un robot extracteur permettant l’extraction d’acides
nucléiques à partir de sources diverses de manière
rapide et reproductible avec un haut degré de pureté,
d’un robot pipeteur pour le pipetage automatisé des produits
de PCR ou de RT PCR selon les protocoles d’amplification d’ADN,
et d’un thermocycleur afin de lire en temps réel la fluorescence
des amplicons, ainsi que des thermocycleurs conventionnels, thermocycleur
avec gradient et Hotte PCR.
Ces expertises servent pour la détection des polymorphismes,
le diagnostic médical, la détection et la quantification
d’OGM, l’analyse de l’expression des gènes,
Option HRM (criblage rapide des mutations et identification bactérienne)…
En plus de ces services, la Plateforme Génomique Fonctionnelle
organise des séminaires de formations sur différentes
techniques utilisées au sein de la plateforme, ainsi que des
Workshops sur les nouvelles technologies animés par des experts
nationaux et internationaux.
La plate forme mise beaucoup sur la qualité (Contrôle qualité,
écoute, traitement des réclamations…), elle entame
d’ailleurs la démarche qualité ISO 17025…
à noter également que le système de traçabilité
des échantillons et des données est complètement
informatisé..