Septembre 2006 - n°1
Institut Pasteur
Maroc : zoom sur le laboratoire de diagnostic moléculaire
L’Institut Pasteur du Maroc (IPM) de Casablanca a été
créé en 1929 pour accomplir trois missions principales
: la recherche, l'amélioration de la Santé Publique et
l'enseignement.
Son champ d’activité se divise en trois segments :
Les activités de production : En 1990, une unité
de production a été spécialement inaugurée
pour assurer la production des vaccins, des sérums thérapeutiques,
des milieux de culture et des réactifs de laboratoires.
Les activités du secteur public : La recherche scientifique
fondamentale et appliquée sur la microbiologie (tuberculose,
chlamydiae, enterobactéries, salmonelles, microbiologie alimentaire…),
la virologie (hépatites virales, rétrovirus, SIDA, IST,
Rage), la biochimie (recherches sur les venins scorpioniques et vipérins
au Maroc) et la génétique (Maladies génétiques
et prédispositions génétiques à certaines
maladies).
Et les activités d’enseignements : organisation
de congrès et de séminaires, enseignement de la microbiologie,
de la parasitologie et de la biologie du développement, préparation
des études approfondies (DEA) et des thèses de 3ème
cycle.
Un outil au service de la santé
publique
Regroupant environ 270 employés, L’Institut Pasteur Maroc
se divise en 5 départements :
- Département médical.
- Département de la recherche scientifique.
- Département de production pharmaceutique et biologique.
- Département analytique.
L’IPM a développé certaines de ses prestations de
service avec son centre de Biologie. Considéré comme le
plus important du Royaume, ce dernier répond à la majorité
des besoins en matière de diagnostic biologique et d’analyses
médicales.
Le laboratoire de biologie moléculaire (du département
de biologie médicale) joue un rôle très important
dans le diagnostic et le suivi thérapeutique des maladies infectieuses,
en particulier dans le domaine des hépatites virales.
Quatre salles composent ce laboratoire :
-
Une salle de préparation
des Mix pour PCR,
-
Une salle de préparation
des échantillons, avec le matériel suivant :
- 2 hottes à flux laminaire,
- 2 centrifugeuses réfrigérées,
- 1 bain-marie,
- 1 bain à sec,
- des réfrigérateurs et congélateurs à
-20°C,
- 1 congélateur à -80°C.
-
Une salle de PCR : complétement
automatisée, cette salle est équipée d’un
Cobas AmpliPrep pour la préparation des acides nucléiques
ARN, un Cobas Amplicor PCR pour l’hybridation et la détection,
et un Cobas Taq Man(PCR en temps réel IVD)
-
Et une salle d’analyse des
produits de PCR : destinée au Génotypage (HBV, HCV),
cette salle est munie d’un bain-marie agité, d’un
agitateur tridimensionnel, d’un générateur, des
cuves pour électrophorèse et d’un thermocycleur.
Le laboratoire fera bientôt l’acquisiton
d’une centrifugeuse réfrigérée à plus
grande vitesse et d’un analyseur de gels avec caméra et
logiciel.
Des techniques de pointes
Travaillant selon les normes européennes, le laboratoire de diagnostic
moléculaire de l’IPM utilise les techniques d’amplification
des acides nucléiques in vitro en routine. Deux types d’activités
caractérisent le laboratoire : une activité de diagnostic
et une activité de recherche.
L’activité de diagnostic :
Trois modèles de tests sont couramment utilisés :
- PCR qualitative :
- Virus de l’hépatite
B (VHB)
- Virus de l’hépatite C (VHC)
- Mycobactéries (M. tuberculosis)
- PCR quantitative :
- Virus de l’hépatite
C
- Virus de l’hépatite B
- Virus de l’immunodéficience humaine
(HIV-1)
- Génotypage des souches VHC.
La charge virale pré-thérapeutique ainsi que
le génotypage du VHC, représentent des paramètres
pronostics jouant un rôle fondamental sur la durée du traitement
antiviral.
Dans le cadre du suivi des patients traités par l’interféron
pegylé en association avec la ribavirine, la recherche qualitative
du VHC représente l’unique marqueur virologique de réponse
thérapeutique.
L’activité de recherche :
Le laboratoire de diagnostic moléculaire de l’IPM a plusieurs
projets en cours : par exemple le projet de dépistage des hépatites
B et C au Maroc qui a commencé en 2003 et celui de la caractérisation
moléculaire des souches du virus de l’hépatite C
au Maroc. Le labo dispose d’une chaîne ELISA, d’un
laveur de microplaque et d’un incubateur pour ses activités
de dépistage.
Ainsi, et toujours dans le cadre de ses objectifs de développement,
le laboratoire poursuit ses travaux pour compléter le plateau
technique de diagnostic moléculaire d’autres pathologies
infectieuses, et pour étudier la résistance moléculaire
du VHC et du VHB au traitement antiviral.
Le thème principal développé est l’étude
de l’épidémiologie moléculaire de l’hépatite
virale C au Maroc.
Les résultats du premier travail de dépistage ont montré
des prévalences de l’ordre de 1,1% et 1,78% des hépatites
B et C respectivement. Les résultats de typage moléculaire
des souches VHC au Maroc ont été publiés en 1997
dans une revue internationale (J Med Virol). Ces résultats ont
montré l’existence de deux génotypes majeurs VHC
(génotypes 1 et 2) avec une prédominance des sous-types
1b et 2a/2c (figure1). Chez les patients présentant une cirrhose
du foie, le sous-type 1b prédomine, ces résultats montrent
l’association du sous-type 1b avec la sévérité
de la maladie. Par ailleurs, chez les hémodialysés, le
sous-type 1b est majoritaire, ce qui plaide en faveur d’une transmission
nosocomiale de l’infection chez ce groupe de patient à
haut risque.
Deux autres publications sont en cours de préparation, elles
concernent le dépistage des hépatites B et C ainsi que
leur caractérisation moléculaire.
L’équipe qui veille au bon déroulement des recherches
du labo est composée du Dr. Abdelouaheb Bennani, PhD en biologie
moléculaire et de deux ingénieurs en plus des étudiants
et des stagiaires.
Des études épidémiologiques sur les virus récemment
découverts suscitent l’intérêt du laboratoire:
le virus de l’hépatite G (VHG) et le virus TTV (transfusion
transmitted virus) qui sont probablement associés aux hépatites
virales mais dont la pathologie reste très discutée.
Le laboratoire de diagnostic moléculaire travaille en collaboration
avec toutes les facultés de médecine, de sciences, des
sciences et techniques et les CHU au Maroc.
Il a aussi des partenariats avec des laboratoires d’analyses médicales
privés.
K.BERRAMOU
Contact
:
Dr A. BENANI, Responsable
Laboratoire de Biologie Moléculaire
Centre de Biologie Médicale
Institut Pasteur du Maroc
Tél : 00 212 61 29 11 62
Fax: 00 212 22 26 09 57
E-mail : abdelouaheb.bennani@pasteur.ma
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